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基于miRNA-mRNA 网络筛查并验证胃癌诊断和预后评估相关的标志 物及其潜在分子机制
Meta描述:
目的：通过生物信息学方法探索并实验验证胃癌相关标志物miR-1-3p对胃癌细胞增殖的作用及其分子机制。方法：收 集TCGA 数据库中胃癌（n=375）及癌旁组织（n=45）的转录组数据，构建胃癌特异性mRNA-miRNA 网络，筛选潜在的miRNA 类标 志物，利用TargetScan 预测标志物的下游靶基因且分析它们的功能。选取人正常胃上皮细胞GES-1 及胃癌细胞AGS、MKN45、NCI-N87，用qPCR 法检测细胞中miR-1-3p 和心肌蛋白（MYOCD）的表达，用lipofectamine 2000 将miR-1-3p 模拟物转染至胃癌细 胞中，CCK-8 法测定轨染后细胞的增殖能力，WB 法测定MYOCD 的表达量，双荧光素酶报告基因实验验证miR-1-3p 与MYOCD 之间的靶向结合关系。结果：通过数据库数据分析得到差异表达的259 个miRNA 和7 545 个mRNA，构建胃癌特异性mRNA-miRNA 调节网络，分析网络中脆弱结构后确定miR-1-3p 为潜在的胃癌标志物，ROC 曲线和Kaplan-Meier 分析显示其对胃癌的诊 断和预后评估有重要意义。细胞实验显示miR-1-3p 在胃癌细胞中呈低表达（P<0.05），过表达miR-1-3p 可抑制胃癌细胞AGS 和 MKN-45 的增殖能力（P<0.05 或P<0.01），且可抑制MYOCD的表达（P<0.01）。TargetScan数据库预测到MYOCD 的3'UTR 区域中有 两个与miR-1-3p 结合的位点，双荧光素酶报告基因实验证实miR-1-3p 与MYOCD 靶向结合且负调控MYOCD 的表达（P<0.01）。结论: miR-1-3p 可能是胃癌诊断和预后相关潜在的标志物，且miR-1-3p 可能是通过靶向MYOCD 来影响胃癌细胞的增殖。
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Keywords:
胃癌;miR-1-3p;心肌蛋白;诊断;预后;生物标志物
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基于miRNA-mRNA 网络筛查并验证胃癌诊断和预后评估相关的标志 物及其潜在分子机制
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